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从零开始搭建深度学习服务器: 深度学习工具安装(TensorFlow + PyTorch + Torch)

Deep Learning Specialization on Coursera

这个系列写了好几篇文章,这是相关文章的索引,仅供参考:

以下是相关深度学习工具包的安装,包括Tensorflow, PyTorch, Torch等:

1. TensorFlow:

首先安装libcupti-dev

sudo apt-get install libcupti-dev

然后用 virtualenv 方式安装 Tensorflow(当前是1.4版本)

sudo apt-get install python-pip python-dev python-virtualenv 
mkdir tensorflow
cd tensorflow
virtualenv --system-site-packages venv
source venv/bin/activate
pip install --upgrade tensorflow-gpu

测试GPU:

Python 2.7.12 (default, Nov 19 2016, 06:48:10) 
[GCC 5.4.0 20160609] on linux2
Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information.
>>> import tensorflow as tf
>>> sess = tf.Session(config=tf.ConfigProto(log_device_placement=True))
...
2017-10-24 20:37:24.290049: I tensorflow/core/common_runtime/gpu/gpu_device.cc:955] Found device 0 with properties: 
name: GeForce GTX 1080 Ti
major: 6 minor: 1 memoryClockRate (GHz) 1.6575
pciBusID 0000:01:00.0
Total memory: 10.91GiB
Free memory: 10.52GiB
...
2017-10-24 20:37:24.387363: I tensorflow/core/common_runtime/gpu/gpu_device.cc:955] Found device 1 with properties: 
name: GeForce GTX 1080 Ti
major: 6 minor: 1 memoryClockRate (GHz) 1.6575
pciBusID 0000:02:00.0
Total memory: 10.91GiB
Free memory: 10.76GiB
2017-10-24 20:37:24.388168: I tensorflow/core/common_runtime/gpu/gpu_device.cc:976] DMA: 0 1 
2017-10-24 20:37:24.388176: I tensorflow/core/common_runtime/gpu/gpu_device.cc:986] 0:   Y Y 
2017-10-24 20:37:24.388179: I tensorflow/core/common_runtime/gpu/gpu_device.cc:986] 1:   Y Y 
2017-10-24 20:37:24.388186: I tensorflow/core/common_runtime/gpu/gpu_device.cc:1045] Creating TensorFlow device (/gpu:0) -> (device: 0, name: GeForce GTX 1080 Ti, pci bus id: 0000:01:00.0)
2017-10-24 20:37:24.388189: I tensorflow/core/common_runtime/gpu/gpu_device.cc:1045] Creating TensorFlow device (/gpu:1) -> (device: 1, name: GeForce GTX 1080 Ti, pci bus id: 0000:02:00.0)
Device mapping:
/job:localhost/replica:0/task:0/gpu:0 -> device: 0, name: GeForce GTX 1080 Ti, pci bus id: 0000:01:00.0
/job:localhost/replica:0/task:0/gpu:1 -> device: 1, name: GeForce GTX 1080 Ti, pci bus id: 0000:02:00.0
2017-10-24 20:37:24.449867: I tensorflow/core/common_runtime/direct_session.cc:300] Device mapping:
/job:localhost/replica:0/task:0/gpu:0 -> device: 0, name: GeForce GTX 1080 Ti, pci bus id: 0000:01:00.0
/job:localhost/replica:0/task:0/gpu:1 -> device: 1, name: GeForce GTX 1080 Ti, pci bus id: 0000:02:00.0
>>> 

2. PyTorch:

首先在PyTorch的官网下载对应的pip安装文件:

然后用virtualenv的方式安装,非常方便:

mkdir pytorch
cd pytorch/
virtualenv venv
source venv/bin/activate
pip install /path/to/torch-0.2.0.post3-cp27-cp27mu-manylinux1_x86_64.whl 
pip install torchvision 

3. Torch

首先按照Torch官方的方法进行安装:http://torch.ch/docs/getting-started.html

git clone https://github.com/torch/distro.git ~/torch --recursive
cd ~/torch; bash install-deps;
./install.sh

如无意外,可以顺利安装,如果遇到了如下两个问题,可按下述方法修改:

1) 执行./install.sh时出现Moses>=1.错误

Missing dependencies for nn:moses >= 1.,有时候执行./install.sh时,会出现这个问题。

用这个方法解决:

sudo apt install luarocks
sudo luarocks install moses

2) install.sh 过程中提示“error -- unsupported GNU version! gcc versions later than 5 are not supported!”

ubuntu17.04自带gcc 6.x 版本,所以降级安装gcc 4.9版本解决问题:

sudo apt-get install g++-4.9  
sudo update-alternatives --install /usr/bin/gcc gcc /usr/bin/gcc-4.9 20  
sudo update-alternatives --install /usr/bin/g++ g++ /usr/bin/g++-4.9 20 

成功执行安装脚本后后提示:

Do you want to automatically prepend the Torch install location
to PATH and LD_LIBRARY_PATH in your /home/yourpath/.bashrc? (yes/no)
[yes] >>>
yes

安装脚本会自动将torch的安装路径写入到 .bashrc里,然后输入 th试试:

如果你想用Lua5.2替代LuaJIT的方式安装Torch(If you want to install torch with Lua 5.2 instead of LuaJIT, simply run),可按如下方式安装:

git clone https://github.com/torch/distro.git torch --recursive
cd torch

# clean old torch installation
./clean.sh

在 ~/.bashrec中设置lua的环境:
TORCH_LUA_VERSION=LUA52
并执行 source ~/.bashrc, 然后运行:

./install.sh

遇到第一个问题:

cmake: not found

安装cmake解决:
sudo apt-get install cmake

第二个问题:
readline.c:8:31: fatal error: readline/readline.h: 没有那个文件或目录

安装libreadine-dev解决:
sudo apt-get install libreadline-dev

第三个问题:安装过程依然提示“error -- unsupported GNU version! gcc versions later than 5 are not supported!”

ubuntu17.04自带gcc 6.x 版本,所以降级安装gcc 4.9版本解决问题:

sudo apt-get install g++-4.9
sudo update-alternatives --install /usr/bin/gcc gcc /usr/bin/gcc-4.9 20
sudo update-alternatives --install /usr/bin/g++ g++ /usr/bin/g++-4.9 20

安装完毕依然会提示:

Not updating your shell profile.
You might want to
add the following lines to your shell profile:

. /home/textminer/torch/torch/install/bin/torch-activate

在 ~/.profile 文件末尾加上这行 ". /home/textminer/torch/torch/install/bin/torch-activate " 并执行 source ~/.profile,然后输入 th试试。

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从零开始搭建深度学习服务器: 基础环境配置(Ubuntu + GTX 1080 TI + CUDA + cuDNN)

Deep Learning Specialization on Coursera

去年上半年配置了一台GTX1080深度学习主机:深度学习主机攒机小记,然后分别写了两篇深度学习环境配置的文章:深度学习主机环境配置: Ubuntu16.04+Nvidia GTX 1080+CUDA8.0深度学习主机环境配置: Ubuntu16.04+GeForce GTX 1080+TensorFlow,得到了很多同学留言,不过这个一年多以前完成的深度学习环境配置方案显得有些落伍了。这一年里,深度学习领域继续高歌猛进,包括 Andrew Ng 也离开百度出来创业了,他的第一个项目是deeplearning.ai,和Coursera合作推出了一个深度学习专项课程系列: Andrew Ng 深度学习课程小记。另外GTX1080的升级版1080TI显卡的发售也刺激了深度学习服务器的配置升级,我也机缘巧合的配置了3台1080TI深度学习服务器:从零开始搭建深度学习服务器:硬件选择。同时深度学习工具的开发迭代速度也惊人,Theano在完成了自己的历史使命后选择了停止更新,以这样的方式了退出了深度学习的舞台,而 TensorFlow,Torch,Pytorch 等工具和周边也发展迅猛。因为一次偶然事件,我又一次为老机器重装了系统环境,并且选则了最新的cuda9, cudnn7.0等基础工具版本: 深度学习服务器环境配置: Ubuntu17.04+Nvidia GTX 1080+CUDA 9.0+cuDNN 7.0+TensorFlow 1.3。不过回过头来,发现这种源代码方式编译 TensorFlow GPU 版本的方式在国内的网络环境下并不方便,而我更喜欢 CUDA8 + cuDNN6 + Tensorflow + Pytorch + Torch 的安装方案,简明扼要并且比较方便,于是在新的深度学习主机里我分别在Ubunu17.04和Ubuntu16.04的系统环境下配置了这样的深度学习服务器环境,下面就是相关的安装记录,希望这能成为一份简单的深度学习服务器环境配置指南。

1. 安装Ubuntu系统: Ubuntu16.04 或者 Ubuntu17.04

从Ubuntu官方直接下载Ubuntu镜像(Ubuntu16.04或者Ubuntu17.04,采用的是desktop amd64版本),用U盘和Ubuntu镜像制作安装盘。在MAC下制作 Ubuntu USB 安装盘的方法可参考: 在MAC下使用ISO制作Linux的安装USB盘,之后通过Bios引导U盘启动安装Ubuntu系统。如果安装的时候出现类似黑屏或者类似 "nouveau ... fifo ..."之类的报错信息,重启电脑,进入安装界面时候长按e,进入图形界面,按F6,选择 nomodeset 或者手动添加,进行Ubuntu系统的安装。参考《深度学习主机环境配置: Ubuntu16.04+Nvidia GTX 1080+CUDA8.0》。

2. Source源和Pip源设置:

系统安装完毕后建议设置一下source源和pip源,这样可以加速安装相关的工具包。

cd /etc/apt/
sudo cp sources.list sources.list.bak
sudo vi sources.list

对于Ubuntu16.04,我用的是阿里云的源,把下面的这些源添加到source.list文件头部:

deb-src http://archive.ubuntu.com/ubuntu xenial main restricted #Added by software-properties
deb http://mirrors.aliyun.com/ubuntu/ xenial main restricted
deb-src http://mirrors.aliyun.com/ubuntu/ xenial main restricted multiverse universe #Added by software-properties
deb http://mirrors.aliyun.com/ubuntu/ xenial-updates main restricted
deb-src http://mirrors.aliyun.com/ubuntu/ xenial-updates main restricted multiverse universe #Added by software-properties
deb http://mirrors.aliyun.com/ubuntu/ xenial universe
deb http://mirrors.aliyun.com/ubuntu/ xenial-updates universe
deb http://mirrors.aliyun.com/ubuntu/ xenial multiverse
deb http://mirrors.aliyun.com/ubuntu/ xenial-updates multiverse
deb http://mirrors.aliyun.com/ubuntu/ xenial-backports main restricted universe multiverse
deb-src http://mirrors.aliyun.com/ubuntu/ xenial-backports main restricted universe multiverse #Added by software-properties
deb http://archive.canonical.com/ubuntu xenial partner
deb-src http://archive.canonical.com/ubuntu xenial partner
deb http://mirrors.aliyun.com/ubuntu/ xenial-security main restricted
deb-src http://mirrors.aliyun.com/ubuntu/ xenial-security main restricted multiverse universe #Added by software-properties
deb http://mirrors.aliyun.com/ubuntu/ xenial-security universe
deb http://mirrors.aliyun.com/ubuntu/ xenial-security multiverse

对于Ubuntu17.04,我使用的是网易的源:

deb http://mirrors.163.com/ubuntu/ zesty main restricted universe multiverse
deb http://mirrors.163.com/ubuntu/ zesty-security main restricted universe multiverse
deb http://mirrors.163.com/ubuntu/ zesty-updates main restricted universe multiverse
deb http://mirrors.163.com/ubuntu/ zesty-proposed main restricted universe multiverse
deb http://mirrors.163.com/ubuntu/ zesty-backports main restricted universe multiverse
deb-src http://mirrors.163.com/ubuntu/ zesty main restricted universe multiverse
deb-src http://mirrors.163.com/ubuntu/ zesty-security main restricted universe multiverse
deb-src http://mirrors.163.com/ubuntu/ zesty-updates main restricted universe multiverse
deb-src http://mirrors.163.com/ubuntu/ zesty-proposed main restricted universe multiverse
deb-src http://mirrors.163.com/ubuntu/ zesty-backports main restricted universe multiverse

最后更新一下:

sudo apt-get update
sudo apt-get upgrade

另外一个事情是将pip源指向阿里云的源镜像:http://mirrors.aliyun.com/help/pypi,具体添加一个 ~/.config/pip/pip.conf 文件,设置为:

[global]
trusted-host =  mirrors.aliyun.com
index-url = http://mirrors.aliyun.com/pypi/simple

或者清华的pip源,刚好安装的那两天清华的pip源抽风,所以就换阿里云的了。

3. 安装1080TI显卡驱动:

sudo apt-get purge nvidia*
sudo add-apt-repository ppa:graphics-drivers/ppa
sudo apt-get update && sudo apt-get install nvidia-384 nvidia-settings

安装完毕后重启机器,运行 nvidia-smi,看看生效的显卡驱动:

4. 安装CUDA:

因为Tensorflow和Pytorch目前官方提供的PIP版本只支持CUDA8, 所以我选择了安装CUDA8.0。不过目前英文达官方网站的 CUDA-TOOLKIT页面默认提供的是CUDA9.0的下载,所以需要在英文达官方提供的另一个 CUDA Toolkit Archive 页面选择CUDA8,这个页面包含了CUDA所有的历史版本和当前的CUDA9.0版本。点击 CUDA Toolkit 8.0 GA2 (Feb 2017) 这个页面,选择"cuda-repo-ubuntu1604-8-0-local-ga2_8.0.61-1_amd64.deb" 和 "cuBLAS Patch Update to CUDA 8":

sudo dpkg -i cuda-repo-ubuntu1604-8-0-local-ga2_8.0.61-1_amd64.deb
sudo apt-get update
sudo apt-get install cuda

如果之前没有安装上述"cuBLAS Patch Update to CUDA 8",可以用如下方式安装更新:

sudo dpkg -i cuda-repo-ubuntu1604-8-0-local-cublas-performance-update_8.0.61-1_amd64.deb
sudo apt-get update  
sudo apt-get upgrade cuda

在 ~/.bashrc 中设置环境变量:

export PATH=/usr/local/cuda/bin${PATH:+:${PATH}}
export LD_LIBRARY_PATH=/usr/local/cuda/lib64${LD_LIBRARY_PATH:+:${LD_LIBRARY_PATH}}
export CUDA_HOME=/usr/local/cuda

运行 source ~/.bashrc 使其生效

4. 安装cuDNN:

cuDNN7.0 虽然出来了,但是 CUDA8 的最佳拍档依然是cuDNN6.0,在NIVIDA开发者官网上,找到cudnn的下载页面: https://developer.nvidia.com/rdp/cudnn-download ,选择"Download cuDNN v6.0 (April 27, 2017), for CUDA 8.0" 中的 "cuDNN v6.0 Library for Linux":

下载后安装非常简单,就是解压然后拷贝到相应的系统CUDA路径下,注意最后一行拷贝时 "-d"不能少, 否则会提示.so不是symbol link:

tar -zxvf cudnn-8.0-linux-x64-v6.0.tgz 
sudo cp cuda/include/cudnn.h /usr/local/cuda/include/
sudo cp cuda/lib64/libcudnn* /usr/local/cuda/lib64/ -d

以上是安装均在Ubunt16.04和Ubuntu17.04环境下测试通过,最后鉴于最近一些相关文章评论有同学留言无法从官方下载CUDA和cuDNN,亲测可能与国内环境有关,我将cuda8.0, cuda9.0, cudnn6.0, cudnn7.0的相关工具包上传到了百度网盘,提供两个下载地址:

CUDA8.0 & CUDA9.0下载地址:链接: https://pan.baidu.com/s/1gfaS4lt 密码 ddji ,包括:

1) CUDA8.0 for Ubuntu16.04: cuda-repo-ubuntu1604-8-0-local-ga2_8.0.61-1_amd64.deb
2) CUDA8.0 for Ubuntu16.04 更新: cuda-repo-ubuntu1604-8-0-local-cublas-performance-update_8.0.61-1_amd64
3) CUDA9.0 for Ubuntu16.04: cuda-repo-ubuntu1604-9-0-local_9.0.176-1_amd64.deb
4) CUDA9.0 for Ubuntu17.04: cuda-repo-ubuntu1704-9-0-local_9.0.176-1_amd64

cuDNN6.0 & cuDNN7.0下载地址:链接: https://pan.baidu.com/s/1qXIZqpA 密码 cwch ,包括:

1) cudnn6.0 for CUDA8: cudnn-8.0-linux-x64-v6.0.tgz
2) cudnn7.0 for CUDA8: cudnn-8.0-linux-x64-v7.tgz
3) cudnn7.0 for CUDA9: cudnn-9.0-linux-x64-v7.tgz

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